भारत में यूरोपीय लोगों द्वारा निर्मित सबसे पुराने चर्चों में से एक, सेंट फ्रांसिस चर्च अपने खूबसूरत डिजाइन और परिवेश के लिए जाना जाता है। एक भव्य इमारत जिसकी विशाल छत लकड़ी से बनी है और टाइलों से ढकी हुई है।  चर्च के दोनों बाहरी भागों पर दोनों ओर दो खड़ी मीनारें हैं। इसे 1503 में पुर्तगाली फ्रैंकिस्कन्स फ्रार्स समूह द्वारा बनाया गया था। शुरू में, यह एक मिट्टी और लकड़ी की इमारत थी और सेंट बार्थोलोम्यू को समर्पित थी, और बाद में पुर्तगाल के संरक्षक संत सेंट एंटोनियो को समर्पित कर दी गई। 1524 में, केरल की अपनी तीसरी यात्रा पर, पुर्तगाली खोजकर्ता, वास्को डी गामा, जो समुद्र के रास्ते यूरोप से भारत पहुंचे थे, बीमार पड़ गए और कोच्चि में उनकी मृत्यु हो गई। उन्हें सेंट फ्रांसिस चर्च में दफनाया गया था। लगभग 14 साल बाद, उनके अवशेषों को पुर्तगाल वापस ले जाया गया। चर्च के अंदर जहां उन्हें दफनाया गया था, उस स्थान का सीमांकन किया गया है।

भारतीय पुरातत्व सर्वेक्षण (एएसआई) के तहत संरक्षित, यह चर्च सप्ताह के दिनों में आगंतुकों के लिए खुला रहता है। रविवार और विशेष दिनों में, चर्च में सर्विसेस होती हैं।

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