पेरियार नदी और पश्चिमी घाटों के बीच स्थित, कोच्चि से 50 किलोमीटर दूर एर्नाकुलम जिले में स्थित मलयट्टूर का अनोखा शहर एक शांत पर्यटन स्थल है। इसका मुख्य आकर्षण है कैथोलिक चर्च, जो एपोस्टल सेंट थॉमस को समर्पित है। 609 मीटर ऊंचे मलयट्टूर हिल पर स्थित चर्च में दूर-दूर लोग आते हैं। मार्च और अप्रैल के महीनों के दौरान आयोजित एक वार्षिक त्योहार, मलयट्टूर पेरुनाल के दौरान यहां बड़ी संख्या में लोग आते हैं। माना जाता है कि सेंट थॉमस को समर्पित यह सबसे बड़ा तीर्थ केंद्र है। चर्च सेंट थॉमस फीस्ट के दौरान यहां का नजारा कुछ और ही होता है जो ईस्टर के बाद रविवार को आयोजित किया जाता है।पर्यटक सेंट सेबेस्टियन चर्च और पास में स्थित मैरी इमैक्युलेट के चर्च भी जा सकते हैं। यह शहर दुर्गा देवी मंदिर के लिए भी प्रसिद्ध है जहां पर्यटकों की हमेशा भीड़ लगी रहती है।