El museo arqueológico fue establecido por Sir John Marshall en 1919, pero debido a la falta de espacio, fue trasladado al sitio actual en 1966. La mayoría de las exposiciones son de Sanchi, pero algunas han sido traídas de Vidisha, Gulgaon, etc. Entre las exposiciones más populares del Museo Sanchi se encuentra la corona de la capital del león de Ashoka. Es la escultura que ha inspirado el Emblema Nacional de la India y que atrae a un gran número de personas al museo. Entre otras esculturas que no hay que perderse están la escultura Nagaraja de la dinastía Sunga (siglo II), una intrincada estatua de Yakshi del siglo I, y una estatua del Señor Buda en una pose meditativa del siglo VII.

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