Créé par Mahasiddha Naropa, un bouddhiste indien, le monastère de Dzongkhul est un lieu dédié au repos et à la méditation. La grotte dans laquelle Naropa aurait passé quelques temps se trouve toujours sur le site de ce monastère. On dit que c’est à cet endroit qu’il a frappé un rocher avec son bâton et que c’est ce qui a donné naissance à ce monastère. Un grand nombre de Mahāsiddhas de Zanskar ont médité ici, dont Dubchen Kunga Gyatso, Dubchen Nawang Tsering, Dzadpa Dorje, Karmapa, Kunga Choslag et lama Norboo. Ce monastère abrite des objets de grande importance comme une représentation de Samvara, un stupa en cristal, ainsi que des textes religieux contenant des biographies et des textes sacrés. On y trouve également une grotte de méditation censée contenir une empreinte de pas de Panchen Naropa creusée dans un rocher, ainsi que sa source sacrée encore vénérée de nos jours.