Construido para Ta Sangs (monjes tibetanos puros) en 1705, este monasterio de tres pisos es uno de los más famosos del estado de Sikkim. Comenzó con un pequeño santuario llamado "Tsangkhang", fundado por Lhatsun Chhenpo entre 1650 y 1651 d. C. Este santuario fue posteriormente trasladado al sitio actual y reestablecido en 1705 por Chhogyal Chhagdor Namgyal y Lama Khanchhen Rolpai Dorje (primer lama jefe de la Gompa de Pemayangtse). Una pequeña estructura religiosa cerca de la entrada tiene una estatua sagrada de Dorje Phagmo (Vajra Varahi) que fue regalada a Chogyal Gyurmed Namgyal por Terton Terdag Lingpa del Tíbet al casarse con su hija.

El festival principal aquí es el Guru Drakmar chham que se celebra en invierno desde febrero a marzo. Con más de 100 monjes en la actualidad, el Monasterio de Pemayangtse es considerado como el padre de todos los monasterios que siguen el linaje de Mindroling en Sikkim..

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