Wahrscheinlich die bekannteste Kirche in Goa und von Christen weltweit am meisten verehrt, ist die Basilica of Bom Jesus in Old Goa berühmt für die Unterbringung der sterblichen Überreste von St. Francis Xavier. Dieser Komplex steht gemeinsam mit einigen anderen Kirchen von Old Goa auf der Liste des UNESCO-Weltkulturerbes. Die Außenfassade, die aus schwarzem Granit gefertigt wurde, ist für die barocke Architektur in Kombination mit dorischen, korinthischen und anderen gemischten Einflüssen bekannt.

Der Hauptaltar im Inneren ist 9 m breit und 16 m hoch und seine Säulen wurden aus Basalt aus dem ca. 300 km entfernten Bassein (heute Vasai, eine Stadt in Maharashtra) errichtet. Er ist reich vergoldet und zeigt die Figur des Jesuskindes, über der eine Statue des heiligen Ignatius Loyola, dem Gründer des Jesuitenordens, steht. Letzterer blickt auf ein Medaillon, über dem die Heilige Dreifaltigkeit (Vater, Sohn und Heiliger Geist) dargestellt ist. An der Südseite der Basilika befindet sich die Kapelle, in der die sakralen Reliquien des heiligen Franz Xaver aufbewahrt werden. Das Innere der Kirche ist reich verziert mit Holzschnitzereien und Gemälden, die Szenen aus dem Leben des heiligen Xaver darstellen. Eine silberne Schatulle, die die sakralen Reliquien des Heiligen enthält, ist in sieben Tafeln unterteilt, von denen jede zwei Platten enthält, die repräsentativ für die Ereignisse im Leben des Heiligen sind.

Die Church of St. Francis of Assisi befindet sich auf dem Hauptplatz der Altstadt von Goa und ist etwa 10 km von Panaji entfernt. Die Kirche wurde von acht Franziskanermönchen gegründet, die 1517 in Goa landeten. Unter Beibehaltung des portugiesisch-manuelinischen Portals der früheren Struktur, die 1665 erbaut wurde, bietet die Kirche des St. Franziskus von Assisi einen faszinierenden visuellen Kontrast zwischen ihrer schlichten Außenfassade und ihrem aufwendigen barocken Inneren. Das Innere ist von korinthischen Einflüssen geprägt und wunderschön dekoriert. Der Hauptaltar ist der Höhepunkt, über dem sich eine große Statue des Heiligen Franz von Assisi erhebt, zusammen mit einer weiteren Statue von Jesus Christus. Der Altar wird auf beiden Seiten von Holzbildern flankiert, die das Leben und die Zeit des Schutzpatrons St. Franziskus darstellen.

Das Gotteshaus war ursprünglich eine Kapelle, die 1521 zur Kirche ausgebaut und 1602 eingeweiht wurde, wobei der heutige Bau 1661 errichtet wurde. Angrenzend an die Kirche befindet sich das Kloster, das heute ein Museum beherbergt. Es wurde 1964 von der Archäological Survey of India (ASI) eingerichtet und beherbergt Gemälde, Skulpturen und andere Artefakte, die mit der Geschichte und Kultur von Goa in Verbindung stehen. Die nach Westen ausgerichtete Kirche besteht aus einem Kirchenschiff mit drei Kapellen an beiden Seiten, einem Hauptaltar und einem Chor.

Die St. Cajetan’s Church ist eine der malerischsten Kirchen in Goa. Diese wunderschöne Struktur befindet sich in der Altstadt von Goa, in der Nähe der Se Cathedral. St. Cajetan’s Church wurde 1665 von italienischen Mönchen des Ordens der Theatiner erbaut und ist ein Musterbeispiel des korinthischen Baustils. In Nischen an der Außenfassade befinden sich vier atemberaubende Statuen von den Aposteln Paulus, Petrus, Matthäus und Johannes dem Evangelisten.

Das Interieur, das ebenfalls korinthische Elemente aufweist, verfügt über Barock-, Rokoko- und Goan-Einflüsse mit Goldarbeiten. Ursprünglich wurde die Kirche Our Lady of Divine Providence genannt und ist immer noch ihr gewidmet. Das Gebäude der Kirche ist aus Lateritblöcken gebaut, die mit Kalk verputzt wurden. Die Fassade der Kirche hat zwei Türme auf beiden Seiten, die als Glockenturm dienen. Wenn man die Kirche betritt, findet man links drei Altäre, die der Heiligen Familie, der Muttergottes der Frömmigkeit und der heiligen Klara gewidmet sind. Auf der rechten Seite befinden sich die Altäre des Heiligen Johannes, des Heiligen Cajetan und der Heiligen Agnes. Der größte Altar auf der rechten Seite ist dem heiligen Cajetan geweiht.

Die Our Lady of Immaculate Conception Church, die sich in der Hauptstadt Panaji befindet, wurde 1541 vermutlich ursprünglich als Kapelle gebaut, um den religiösen Bedürfnissen der portugiesischen Seeleute zu entsprechen. Die Kapelle wurde schließlich 1600 zur Pfarrei und neun Jahre später durch eine Kirche ersetzt. Ihre symmetrische zickzackförmige Treppe wurde im 18. Jahrhundert konstruiert. Man glaubt, dass die Kirche nach dem Vorbild der Bom Jesus de Braga Kirche in Portugal gebaut wurde, mit einem mittleren und vier seitlichen Podesten in perfekter Symmetrie.

Die Statue der Muttergottes wurde 1954 auf einem 5 m hohen Sockel auf dem mittleren Treppenabsatz aufgestellt. In der Kirche befindet sich auch eine alte Glocke, die von den augustinischen Ruinen der Church of Our Lady of Grace stammt. Die Glocke gilt als die zweitgrößte ihrer Art in Goa, die größte ist die Goldene Glocke, die in der Se Cathedral untergebracht ist. Mit ihrer weißen Fassade, die portugiesisch-barocke und goanesische Architekturstile aufweist, verfügt die Kirche über zwei Türme und einen aufragenden Glockenturm. Da die Kirche schon von weitem sichtbar ist, wird sie auch als Krone von Panaji bezeichnet. Um die Kirche zu erreichen, muss man 78 Stufen hinaufsteigen. Während der Hauptaltar in der Kirche der Mutter Maria gewidmet ist, sind die beiden anderen Altäre auf beiden Seiten aufwendig geschnitzt und vergoldet. Einer davon ist der Kreuzigung Jesu und der andere der Muttergottes des Rosenkranzes gewidmet. Marmorstatuen der Heiligen Petrus und Paulus flankieren diese beiden Altäre. Jedes Jahr am 8. Dezember wird die Kirche beleuchtet, um das Fest der Muttergottes der Unbefleckten Empfängnis zu feiern. Diesen Feiern geht eine neuntägige Novene zur Muttergottes voraus.