Die Church of St. Francis of Assisi befindet sich auf dem Hauptplatz der Altstadt von Goa und ist etwa 10 km von Panaji entfernt. Die Kirche wurde von acht Franziskanermönchen gegründet, die 1517 in Goa landeten. Unter Beibehaltung des portugiesisch-manuelinischen Portals der früheren Struktur, die 1665 erbaut wurde, bietet die Kirche des St. Franziskus von Assisi einen faszinierenden visuellen Kontrast zwischen ihrer schlichten Außenfassade und ihrem aufwendigen barocken Inneren. Das Innere ist von korinthischen Einflüssen geprägt und wunderschön dekoriert. Der Hauptaltar ist der Höhepunkt, über dem sich eine große Statue des Heiligen Franz von Assisi erhebt, zusammen mit einer weiteren Statue von Jesus Christus. Der Altar wird auf beiden Seiten von Holzbildern flankiert, die das Leben und die Zeit des Schutzpatrons St. Franziskus darstellen.

Das Gotteshaus war ursprünglich eine Kapelle, die 1521 zur Kirche ausgebaut und 1602 eingeweiht wurde, wobei der heutige Bau 1661 errichtet wurde. Angrenzend an die Kirche befindet sich das Kloster, das heute ein Museum beherbergt. Es wurde 1964 von der Archäological Survey of India (ASI) eingerichtet und beherbergt Gemälde, Skulpturen und andere Artefakte, die mit der Geschichte und Kultur von Goa in Verbindung stehen. Die nach Westen ausgerichtete Kirche besteht aus einem Kirchenschiff mit drei Kapellen an beiden Seiten, einem Hauptaltar und einem Chor.